在动画版故事结束的2年后,作为保护地球对抗外星威胁者的GGG对犯罪组织バイオネット进行追查,但追查的同时GGG卷入了Q零件(Qパーツ)的秘密,此时为了重建三重连太阳系而生的索路11游星主抢走Q零件并成为GGG新的敌人,为了阻止游星主的意图,GGG前往理应已毁灭的三重连太阳系,并在当地进行最后的决战……