少年爱德华·艾尔利克和弟弟阿尔芬斯·艾尔利克十分思念亡故的母亲,为此他们不惜实行了炼金术中最大的禁忌——传说中可以将死者复活的“人体炼成”。 但是炼成失败了,爱德华德失去了左腿,阿尔芬斯则失去了全身。爱德华以牺牲自己的右臂为代价,将弟弟的灵魂炼成并固定在一副铠甲上。 之后,爱德华和阿尔芬斯一起,为了找回所失去的一切,踏上了寻找拥有极大力量的“贤者之石”的旅程。 用钢制义肢“机械铠”代替右臂和左腿的他,被人们称为“钢之炼金术师”……